薬物療法や生活習慣の改善で効果がない重症例や合併症がある場合、逆流を防ぐ手術が検討されます。

代表的な手術は腹腔鏡下で行う噴門形成術で、下部食道括約筋の機能を補強し逆流を防ぎます。