まず問診により症状の経過や便の状態、腹痛の特徴を詳しく確認します。血液検査や便検査で炎症や感染症の有無を調べ、必要に応じて大腸内視鏡検査を行い、炎症性腸疾患や大腸がんなどの器質的疾患がないことを確認します。これらの検査で明らかな異常がなく、症状の経過が診断基準に合致する場合に総合的に診断するかたちとなります。