代表的な症状は腹痛と便通異常です。腹痛は排便によって軽くなることが多いのが特徴で、痛みの程度や部位はさまざまです。便通異常には下痢が続くタイプ、便秘が続くタイプ、下痢と便秘を繰り返すタイプがあります。ガスが溜まりやすい、腹部膨満感があるといった症状もよくみられます。症状は良くなったり悪くなったりを繰り返し、緊張する場面や通勤通学前などに強くなることもあります。