呑酸の最大の原因は胃酸の逆流です。下部食道括約筋のゆるみや、食道裂孔ヘルニアが関与することが多く、食生活や生活習慣の乱れも大きな要因となります。

脂っこい食事、アルコール、コーヒー、チョコレート、喫煙などは胃酸逆流を助長すると言われており、呑酸が生じやすくなります。

また、肥満や加齢、ストレスも呑酸に関与することが知られています。

その他にも、薬剤（降圧薬、気管支拡張薬など）が原因となって呑酸が起きることもあります。