原因は一つに決まっているわけではなく、いくつかの要因が重なって発症すると考えられています。

胃の動きが悪く食べ物をうまく送り出せないことや、胃酸に対して粘膜が敏感になっていること、さらにはストレスや自律神経の乱れが深く関わっています。

また、ピロリ菌感染後の胃の変化や、過敏性腸症候群のような他の消化管の機能異常と関連することも知られています。