呑酸治療の治療方法は薬物療法となります。胃酸を抑えるプロトンポンプ阻害薬（PPI）やP-CABが有効と言われています。

また必要に応じて、胃酸を中和する制酸薬や胃粘膜保護薬も併用されます。

食道裂孔ヘルニアが原因で重症化している場合には、外科的治療が検討されることもありますが、まずは薬物治療と生活習慣改善を組み合わせることで呑酸を治療することが重要となります。